РНК-связывающие белки OAS1, ZFP36L2 и DHX58 вовлечены в регуляцию сплайсинга мРНК рецептора CD44 в клетках колоректального рака
Регуляция альтернативного сплайсинга осуществляется посредством РНК-связывающих белков. Каждое событие альтернативного сплайсинга контролируется несколькими РНК-связывающими белками, совместное действие которых создаёт распределение продуктов альтернативного сплайсинга в данном типе клеток. Трансмембранный белок CD44 играет важную роль на разных стадиях метастатического каскада и рассматривается как перспективная молекула для терапии опухолевых заболеваний и построения прогностических классификаторов. Однако функции конкретных изоформ этого белка могут существенно различаться. Выполнен биоинформатический поиск РНК-связывающих белков, которые могут определять экспрессию клинически значимых изоформ 3 и 4 белка CD44. Проведённый анализ выявил пять РНК-связывающих белков, три из которых — OAS1, ZFP36L2 и DHX58  — впервые показаны как потенциальные регуляторы исследуемого процесса.
d.maltseva@hse.ru Мальцева Д.В
10.47056/1814-3490-2023-1-34-39
The RNA-binding proteins OAS1, ZFP36L2, and DHX58 are involved in the regulation of CD44 mRNA splicing in colorectal cancer cells
Regulation of alternative splicing is carried out by means of RNA-binding proteins (RBP). Each alternative splicing event is controlled by several RNA-binding proteins, which in combination create the distribution of alternative splicing products in a given cell type. Transmembrane protein CD44 plays an important role at various stages of the metastatic cascade and is considered as a promising molecule for the therapy of tumor diseases and the construction of prognostic classifiers. However, the functions of specific isoforms of this protein may differ significantly. In this work, we performed a bioinformatic search of RBPs that can determine the expression of clinically significant isoforms 3 and 4 of CD44 protein. The analysis revealed five RBPs, three of which (OAS1, ZFP36L2, and DHX58) are shown for the first time as potential regulators of the considered process.