Гипоксия опухоли является одной из главных причин прогрессии и метастазирования колоректального рака. Важнейшим молекулярным механизмом ответа клетки на гипоксию является изменение экспрессии молекул микроРНК, осуществляющих посттранскрипционную регуляцию экспрессии генов. Проведено секвенирование микроРНК и мРНК клеток колоректальной аденокарциномы человека HT-29 под воздействием двух химических агентов, имитирующих гипоксию: хлорида кобальта(II) и оксихинолина. Биоинформатический анализ полученных данных позволил выявить дифференциально экспрессированные изоформы микроРНК (hsa-miR-210-3p|0, hsa-miR-22-3p|0, hsa-let-7a-3p|0, hsa-miR-615-3p|0, hsa-miR-4521|0) и их мишени, изменившиеся под воздействием обеих моделей гипоксии. Обнаружены новые регуляторные механизмы клеточного ответа на гипоксию.

Tumor hypoxia is one of the main reasons of progression and metastasis of colorectal cancer. The important molecular mechanism of cell response to hypoxia consists in up- or down-regulation of microRNA expression. In this work we performed microRNA and mRNA sequencing of human colorectal adenocarcinoma HT-29 cell lines treated with two chemical agents mimicking hypoxia: cobalt (II) chloride and oxyquinoline. Bioinformatics analysis of the obtained data revealed differentially expressed isomiRs (hsa-miR-210-3p|0, hsa-miR-22-3p|0, hsa-let-7a-3p|0, hsa-miR-615-3p|0, hsa-miR-4521|0) and their targets, which changed their expression upon hypoxia induction by both treatments. Thus, we identified new regulatory mechanisms of cellular response to hypoxia.