Поверхностные молекулярные маркеры раковых стволовых клеток: компьютерный анализ полных текстов научных публикаций
Р.Е.Суворов, Я.С.Ким*, А.М.Гисина*, J.H.Chiang**, К.Н.Ярыгин*, А.Ю.Лупатов* - 157-163
Федеральный исследовательский институт “Информатика и управление” РАН, Москва, РФ; *ФГБНУ Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, РФ; **National Cheng Kung University, Tainan City, Taiwan
С помощью методов автоматизированного извлечения и интеллектуального анализа текстов на естественном языке были проанализированы данные о поверхностных маркерах раковых стволовых клеток 27 наиболее распространенных онкологических заболеваний. Источником информации служили полные тексты 8933 англоязычных научных статей, имеющихся в открытом доступе в сети Интернет. В основе процесса анализа текстов лежал поиск упоминаний в составе одного предложения нескольких сущностей: названия нозологической формы заболевания, словосочетания “раковые стволовые клетки” или его синонима, а также молекул кластера дифференцировки. Был получен список поверхностных молекулярных маркеров раковых стволовых клеток, наиболее часто упоминаемых в контексте конкретных опухолевых заболеваний; выявлены маркеры, которые преимущественно используются в исследованиях опухолей человека или животных; сформированы 5 групп опухолей по признаку сходства ассоциированных с ними маркеров.
Ключевые слова: раковые стволовые клетки, поверхностные молекулярные маркеры, обработка текстов на естественном языке, извлечение информации, интеллектуальный анализ данных
Адрес для корреспонденции: alupatov@inbox.ru Лупатов А.Ю.