Выделены и охарактеризованы культуры клеток из эутопического эндометрия и из эктопических очагов эндометриоза у женщин с аномалиями развития матки и влагалища. Клетки обладали фибробластоподобной формой и экспрессировали на высоком уровне CD90, CD73, CD105, CD44, CD146, CD117. Исследуемые культуры клеток in vitro подвергались направленной дифференцировке в адипогенном и остеогенном направлении. Культуры обладали свойствами мультипотентных мезенхимных стромальных клеток и при этом имели in vitro иммунофенотипические различия с культурами клеток из эутопического и эктопического эндометрия женщин без аномалий развития, что позволяет предполагать и их функциональное отличие. Клетки из эутопического эндометрия и из эктопических очагов эндометриоза у женщин с аномалиями развития матки и влагалища можно использовать в качестве модели для исследования этиологии, патогенеза эндометриоза и тестирования новых лекарственных препаратов для данной группы пациенток. Маркеры CD90, CD117 определены как перспективные для разработки малоинвазивной диагностики эндометриоза по культурам клеток из эутопического эндометрия.