Содержание и архив номеров
2025 г., Том 179, № 4 АПРЕЛЬ
Иммунология и микробиология
Прогнозирование метаболического профиля и факторов вирулентности факультативно-анаэробных бактерий из очагов туберкулёзного некроза на основе данных полногеномного секвенирования
Метагеномика сообществ бактерий в содержимом казеозного некроза при туберкулёзе свидетельствует о преобладании факультативных анаэробов. Из туберкулёзного некроза выделены, определены до вида и подвергнуты полногеномному секвенированию 9 штаммов: Staphylococcus hominis — 3; S. epidermidis — 3; Corynebacterium ureicelerivorans — 2; C. kefirresidentii — 1. Прогнозирование метаболических путей и факторов вирулентности показало, что Corynebacterium и Staphylococcus обладают наборами генов, не представленных у Mycobacterium tuberculosis: липазами и протеазами, которые могут участвовать в деградации содержимого казеозного некроза; капсулами на основе глутамата и полисахаридов; уреазами, способными повышать pH казеума; системами поглощения трёхвалентного железа. Предположительно, выделенные виды способны образовывать бактериальный консорциум с M. tuberculosis: Corynebacterium — на ранних этапах, а Staphylococcus — на более поздних этапах некротизации туберкулёзного очага в лёгких.
Ключевые слова: казеозный некроз; полногеномное секвенирование; сателлитная микробиота; METABOLIC; VFANALYZER
Адрес для корреспонденции: obogarkov@mail.ru Огарков О.Б.
DOI: 10.47056/0365-9615-2025-179-4-456-460
Prediction of metabolic profile and virulence factors of facultative-anaerobic bacteria from tuberculous necrosis foci based on whole-genome sequencing data
Metagenomics of bacterial communities in tuberculosis caseous necrosis indicates the predominance of facultative anaerobes. Nine strains were isolated from the tuberculosis necrosis, identified to species and set-up whole-genome sequencing: S. hominis — 3; S. epidermidis — 3; C. ureicelerivorans — 2; C. kefirresidentii — 1. Prediction of metabolic pathways and virulence factors showed that Corynebacterium and Staphylococcus possess genes not represented in M. tuberculosis: lipases and proteases for the degradation of caseous necrosis; glutamate and polysaccharide capsules; ureases capable of increasing the pH of the caseous environment; and trivalent iron uptake systems. It is assumed that the isolated species are able to form a bacterial consortium with M. tuberculosis: Corynebacterium at early stages and Staphylococcus at later stages of necrotization of the tuberculosis focus in the lungs.
Key Words: caseous necrosis; whole-genome sequencing; satellite microbiota; METABOLIC; VFANALYZER