Иммунология и микробиология
Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Streptococcus pyogenes, выделенных от пациентов с различными проявлениями стрептококковой инфекции
А.Г.Минко1, Т.А.Данилова1, Г.А.Данилина1, А.А.Аджиева1, Е.Е.Тихомиров1, В.Г.Жуховицкий1,2 - 602-606
1Лаборатория индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов ФГБУ НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи Минздрава России, Москва, РФ; 2ФГБОУ ДПО РМАНПО Минздрава России, Москва, РФ
У 82 клинических штаммов Streptococcus pyogenes (стрептококки группы А), выделенных от пациентов с различными проявлениями стрептококковой инфекции, методом emm-типирования выявлено 27 emm-типов (n=77) с преобладанием emm-89 (n=15; 18%), emm-75 (n=9; 11%) и emm-1 (n=6; 7%); с практически равной частотой определялись типы emm-3, emm-12 и emm-58 (n=4; по 5%); прочие типы встречались реже. С помощью мультипраймерной ПЦР у штаммов Str. pyogenes выявлены гены суперантигенов speC, speG, speH, speI, speJ, speK, speL, speM, smeZ и ssa; с помощью ПЦР-РВ — гены суперантигена SpeA и цистеиновой протеиназы SpeB. Все изученные штаммы Str. pyogenes содержали гены суперантигенов, причём 98% штаммов обладали наборами из нескольких (от 2 до 7) генов. Число вариантов таких наборов достигало 37; 2% штаммов содержали только один ген суперантигена. Частоты распределения генов суперантигенов у изученных штаммов: speA — 43%; speC — 38%; speG — 93%; speH — 13%; speI — 6%; speJ — 24%; speK — 13%; speL и speM — по 11%; smeZ — 98%; ssa — 15%. Все изученные штаммы Str. pyogenes содержали ген speB. Проведённые исследования показали, что наборы генов суперантигенов стрептококков группы А характеризуются выраженным разнообразием, в той или иной степени связанным с принадлежностью к emm-типу.
Ключевые слова: стрептококк группы А; суперантигены; мультипраймерная ПЦР; ПЦР в реальном времени; emm-типирование
Адрес для корреспонденции: alexi-m@yandex.ru Минко А.Г.
DOI: 10.47056/0365-9615-2023-175-5-602-606
Molecular genetic characterization of Streptococcus pyogenes strains isolated from patients with various manifestations of streptococcal infection
A. G. Minko1, T. A. Danilova1, G. A. Danilina1, A. A. Adzhieva1, E. E. Tikhomirov1, and V. G. Zhukhovitsky1,2
1Laboratory of Indication and Ultrastructural Analysis of Microorganisms, N. F. Gamaleya National Research Center of Epidemiology and Microbiology, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia; 2Russian Medical Academy of Continuous Professional Education, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia
In 82 clinical strains of Streptococcus pyogenes (group A streptococci) isolated from patients with various manifestations of streptococcal infection, emm-typing revealed 27 emm-types (n=77) with a predominance of emm-89 (n=15; 18%), emm-75 (n=9; 11%) and emm-1 (n=6; 7%); types emm-3, emm-12 and emm-58 (n=4; 5% each) were determined with almost equal frequency; other types were less common. The superantigen genes speC, speG, speH, speI, speJ, speK, speL, speM, smeZ, and ssa were identified in Str. pyogenes strains using multiprimer PCR; using real-time PCR — the genes of the superantigen SpeA and cysteine proteinase SpeB. All the studied Str. pyogenes strains contained superantigen genes, and 98% of the strains had sets of several (from 2 to 7) genes. The number of variants of such sets reached 37; 2% of the strains contained only one superantigen gene. The distribution frequencies of superantigen genes in the studied strains were: speA — 43%; speC — 38%; speG — 93%; speH — 13%; speI — 6%; speJ — 24%; speK — 13%; speL and speM — 11% each; smeZ — 98%; ssa — 15%. All studied Str. pyogenes strains contained the speB gene. Our studies have shown that the sets of group A streptococci superantigen genes are characterized by pronounced diversity, to some extent associated with emm-type.
Key Words: group A streptococcus; superantigens; multiprimer PCR; real-time PCR; emm-typing