Приматология
Генотипирование популяции макак по полиморфизму гена нейротрофического фактора мозга методом MAMA (Mismatch Amplification Mutation Assay) ПЦР
У человека в гене BDNF встречается полиморфизм rs6265 (196G>A), ассоциированный с множеством фенотипических проявлений с клинической значимостью. У макак-резусов описан полиморфизм rs309950446 (136G>A) с функциональной значимостью. Для определения данного полиморфизма у макак нами применён метод MAMA ПЦР (Mismatch Amplification Mutation Assay) с некомплементарным матричной цепи нуклеотидом в 3-й позиции от 3'-конца аллельспецифичного праймера (mismatch primers), что дало наилучшую дискриминацию аллелей. Было проведено генотипирование самцов макак-резусов (n=178) и макак яванских (n=90). Среди макак-резусов 16% были носителями генотипа А/А, 34% — генотипа G/G, остальные 50% — G/A. У макак яванских мутантный полиморфный аллель отсутствовал. Проведённое исследование позволяет рассматривать макак-резусов как потенциальную биологическую модель для изучения ген-средового взаимодействия полиморфизма в гене BDNF.
pavlova_laura@mail.ru Павлова Л.Е.
10.47056/0365-9615-2023-175-3-374-378
Genotyping of macaque population on the brain-derived neurotrophic factor gene polymorphism by MAMA (Mismatch Amplification Mutation Assay) PCR
Human rs6265 (196G>A) polymorphism in the BDNF gene is associated with many phenotypic manifestations of clinical significance. Rhesus monkey has the rs309950446 (136G>A) polymorphism of a functional significance. To determine this polymorphism in macaques MAMA PCR method (Mismatch Amplification Mutation Assay) with non-complementary nucleotide to the template chain at the 3rd position from the 3'end of the allele-specific primers (mismatch primers) was used and resulted to best discrimination of the alleles. Genotyping of male rhesus monkeys (n=178) and cynomolgus monkeys was carried out (n=90). 16% among the rhesus macaques were the carriers of the A/A genotype, 34% were carriers of the G/G genotype, and the remaining 50% of G/A. The mutant polymorphic allele was not revealed in the cynomolgus macaques. The study results allows to consider rhesus macaques as a potential biological model for assessment of the gen-environmental interaction of the BDNF gene polymorphism.