Онкология
Применение экзомного секвенирования для поиска мутаций, ассоциированных с наследственными формами рака молочной железы и рака яичников в тувинской этнической группе (пилотное исследование)
П.Гервас1, А.Молоков1, А.Зарубин2, А.А.Шивит-Оол5, Н.Бабышкина1, Н.Шефер3, Е.Топольницкий4, Л.Писарева1, Е.Чойнзонов1, Н.Чердынцева1 - 779-784
1НИИ онкологии, Томский НИМЦ, Томск, РФ; 2НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ, Томск, РФ; 3ОГАУЗ "Томский областной онкологический диспансер", Томск, РФ; 4ФГБОУ ВО Сибирский государственный медицинский университет Минздрава России, Томск, РФ; 5ГБУЗ Республики Тыва "Республиканский онкологический диспансер", Кызыл, Республика Тыва, РФ
С целью поиска новых генов, вовлечённых в патогенез рака молочной железы и яичников (РМЖ/РЯ), проведено полное секвенирование экзома образцов периферической крови тувинок с аналогичным диагнозом. Учитывая высокую стоимость полноэкзомного секвенирования и требования к исследуемому материалу, из 61 образца геномной ДНК были отобраны 9 образцов. У пациенток с РМЖ была обнаружена мутация гена LGR4 (rs34804482), вовлечённого в сигнальный опухоль-опосредованный Wnt-путь, и гена BRWD1 (rs147211854), вовлечённого в ремоделирование хроматина. У пациентки с РЯ и бесплодием в анамнезе была обнаружена мутация гена CITED2 (rs77963348), который вовлечён в патогенез идиопатической недостаточности яичников. У двух пациенток с РМЖ/РЯ была обнаружена мутация гена PDGFRA (rs2291591). У тувинок с диагнозом РМЖ/РЯ впервые обнаружены герминальные патогенные мутации генов LRG4, BRWD1, PDGFRA, CITED2.
Ключевые слова: герминальные мутации; рак молочной железы; рак яичников; этнические группы; тувинцы
Адрес для корреспонденции: pgervas@yandex.ru Гервас П.
DOI: 10.47056/0365-9615-2023-176-12-779-784
Exome sequencing: the search for mutations associated with hereditary breast and ovarian cancer in the Tuvan ethnic group (pilot study)
P. Gervas1, A. Molokov1, A. Zarubin2, A. A. Shivit-Ool5, N. Babyshkina1, N. Shefer3, E. Topolnitsky4, L. Pisareva1, E. Choinzonov1, and N. Cherdyntseva1
1Research Institute of Oncology, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences, Tomsk, Russia; 2Research Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences, Tomsk, Russia; 3Tomsk Regional Oncology Dispensary, Tomsk, Russia; 4Siberian State Medical University, Ministry of Health of the Russian Federation, Tomsk, Russia; 5Tuvan Republican Oncology Dispensary, Kyzyl, Republic of Tyva, Russia
Whole exome sequencing of peripheral blood samples from Tuvan females diagnosed with breast and ovarian cancer (BC/OC) was performed to search for new genes involved in BC/OC pathogenesis. Given the high cost of whole exome sequencing and the requirements for study material, 9 samples were selected from 61 genomic DNA samples. A mutation in the LGR4 gene (rs34804482) involved in the tumor-mediated Wnt signaling pathway and a mutation in the BRWD1 gene (rs147211854) involved in chromatin remodeling were identified in BC patients. A mutation in the CITED2 gene (rs77963348) involved in the pathogenesis of primary ovarian insufficiency was identified in a patient with OC and infertility in history. A mutation in the PDGFRA gene (rs2291591) was identified in two BC/OC patients. LRG4, BRWD1, PDGFRA, and CITED2 germline pathogenic mutations were for the first time discovered in Tuvan females diagnosed with BC/OC.
Key Words: germline mutations; breast cancer; ovarian cancer; ethnic groups; Tuvans