Онкология
Группы длинных некодирующих РНК и микроРНК в регуляции уровня экспрессии ряда опухоль-ассоциированных генов при раке яичников
И.В.Пронина1, Е.А.Филиппова1, О.И.Бровкина1, А.М.Бурденный1, Т.П.Казубская2, Д.Н.Кушлинский2, К.И.Жорданиа2, А.В.Карпухин3, В.И.Логинов1, Э.А.Брага1, Н.Е.Кушлинский2 - 343-349
1ФГБНУ НИИ общей патологии и патофизиологии, Москва, РФ; 2ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва, РФ; 3ФГБНУ Медико-генетический научный центр им. акад. Н.П.Бочкова, Москва, РФ
Проведён поиск взаимодействующих длинных некодирующих РНК (днРНК), микроРНК (миРНК) и мРНК белок-кодирующих генов посредством механизма конкурирующих эндогенных РНК (ceRNA) в опухолях больных раком яичников. Методом ОТ-ПЦР в реальном времени на представительной выборке образцов определены уровни экспрессии 24 днРНК, 20 миРНК и 28 мРНК белок-кодирующих генов, вовлечённых в онкогенез. Проведён анализ корреляций между уровнями днРНК/миРНК и миРНК/мРНК в образцах рака яичников. Определены 8 пар днРНК/миРНК и 17 пар миРНК/мРНК, уровни экспрессии которых имеют отрицательную корреляцию. Определены 5 триплетов из потенциально взаимодействующих днРНК/миРНК/мРНК, среди которых наиболее значимым представляется триплет OIP5-AS1/miR-203a-3p/ZEB1. Полученные данные определяют новые эпигенетические профили, а также новые потенциальные биомаркеры и мишени для таргетной терапии больных раком яичника.
Ключевые слова: рак яичников; длинные некодирующие РНК; микроРНК; механизм конкурирующих эндогенных РНК
Адрес для корреспонденции: burdennyy@gmail.com Бурденный А.М
DOI: 10.47056/0365-9615-2022-174-9-343-349
Long non-coding RNAs and microRNAs groups in the expression level regulation of a number of tumor-associated genes in ovarian cancer
I. V. Pronina1, E. A. Filippova1, O. I. Brovkina1, A. M. Burdennyy1, T. P. Kazubskaya2, D. N. Kushlinskii2, K. I. Zhordania2, A. V. Karpukhin3, V. I. Loginov1, E. A. Braga1, and N. E. Kushlinskii2
1Research Institute of General Pathology and Pathophysiology, Moscow, Russia; 2N. N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia; 3N. P. Bochkov Medical and Genetic Scientific Center, Moscow, Russia
The search for interacting long non-coding RNAs (dnRNAs), microRNAs (miRNAs) and mRNAs of protein-coding genes through the mechanism of competing endogenous RNAs (ceRNAs) in tumors of ovarian cancer patients was carried out. The levels of expression of 24 dnRNAs, 20 miRNAs, and 28 mRNAs of protein-coding genes involved in oncogenesis were determined by real-time RT-PCR on a representative samples' set. Correlations between dnRNA/miRNA and miRNA/mRNA levels in ovarian cancer samples were analyzed. 8 pairs of dnRNA/miRNA and 17 pairs of miRNA/mRNA were identified, the expression levels of which have a negative correlation. 5 triplets of potentially interacting dnRNA/miRNA/mRNA have been identified, among which the most significant triplet is the OIP5-AS1/miR-203a-3p/ZEB1. The data obtained determine new epigenetic profiles, as well as new potential biomarkers and targets for targeted therapy of ovarian cancer patients.
Key Words: ovarian cancer; long non-coding RNAs; microRNAs; mechanism of competing endogenous RNAs