Онкология
Уровень мРНК LINE-1 повышен в свободно циркулирующей РНК плазмы крови у больных колоректальным раком
М.Л.Филипенко1, У.А.Боярских1, Л.С.Лесков4, К.В.Субботина1, Е.А.Храпов1, А.В.Соколов3, И.С.Стилиди2, Н.Е.Кушлинский2 - 242-245
1ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, РФ; 2ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва, РФ; 3ГБУЗ НСО "Городская клиническая больница № 1", Новосибирск, РФ; 4ГБУЗ МО МОНИКИ им. М.Ф.Владимирского, Москва, РФ
Проведён сравнительный количественный анализ уровней мРНК LINE-1 во внеклеточной суммарной РНК плазмы крови больных раком толстой кишки и практически здоровых людей. Для оценки уровня мРНК LINE-1 и 18S rRNA во внеклеточной суммарной РНК плазмы крови выполняли количественную мультиплексную ПЦР, сопряжённую с реакцией обратной транскрипции. Выявлена значимо высокая медиана значений мРНК LINE-1 у больных раком толстой кишки (4.95) по сравнению с контролем (2.3) (p=0.037). Показано, что уровень мРНК LINE-1 в суммарной РНК из плазмы крови может определяться в формате жидкостной биопсии и служить новым потенциальным неинвазивным маркером рака толстой кишки.
Ключевые слова: длинные диспергированные нуклеотидные повторы (LINE); LINE-1; транскрипция; свободно циркулирующая РНК; колоректальный рак
Адрес для корреспонденции: mlfilipenko@gmail.com Филипенко М.Л.
DOI: 10.47056/0365-9615-2022-173-2-242-245
The level of LINE-1 mRNA was increased in extracellular circulating plasma RNA in patients with colorectal cancer
M. L. Filipenko1, U. A. Boyarskikh1, L. S. Leskov4, K. V. Subbotina1, E. A. Khrapov1, A. V. Sokolov3, I. S. Stilidi2, and N. E. Kushlinsky2
1Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Division of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia; 2N. N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia; 3City Clinical Hospital № 1, Novosibirsk, Russia; 4M. F. Vladimirsky Moscow Region Research Clinical Institute, Moscow, Russia
Comparative quantitative analysis of LINE-1 mRNA levels in extracellular total plasma RNA in patients with colon cancer and practically healthy donors was evaluated. Quantitative multiplex PCR coupled with a reverse transcription reaction to assess the level of LINE-1 and 18S rRNA mRNA in extracellular total plasma RNA. We revealed a statistically significantly higher median of LINE-1 mRNA values in colon cancer patients (4.95) than in healthy donors (2.3) (p=0.037). It was shown for the first time that the level of LINE-1 mRNA in total RNA from blood plasma can be determined in the format of a liquid biopsy and serve as a new potential non-invasive marker of colon cancer.
Key Words: long dispersed nucleotide repeats (LINE); LINE-1; transcription; freely circulating RNA; colorectal cancer