Генетика
Выделение фракции нуклеоида из клеток Mycoplasma gallisepticum с синхронизированным клеточным делением
Предполагается, что в адаптации Mycoplasma gallisepticum к неблагоприятным факторам участвуют неизвестные механизмы, одними из которых могут быть локальные перестройки структуры и пространственной организации хромосомы. Для изучения этих механизмов мы получили культуру M. gallisepticum с синхронизированным делением, из которой методом мягкого лизиса клеток и центрифугирования в градиенте сахарозы выделяли фракцию нуклеоида. Анализ протеома, проведённый с помощью жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией, показал, что фракция нуклеоида обогащена ДНК-связывающими белками по сравнению с клеточным лизатом. Подобный анализ поможет найти новые нуклеоид-ассоциированные белки и изучить динамику, распределение и значение их в процессе инфекции и в условиях стресса.
alexanderzubov@icloud.com Зубов А.И.
10.47056/0365-9615-2021-171-6-751-755
Isolation of nucleoid fraction from Mycoplasma gallisepticum cells with synchronized cell division
It is assumed that unknown mechanisms, one of which may be local rearrangements of the structure and spatial organization of the chromosome, may be involved in adaptation Mycoplasma gallisepticum to unfavorable factors. To study these mechanisms, we obtained a culture of M. gallisepticum with synchronized division. We isolated the nucleoid fraction from this culture by the method of cell lysis and centrifugation in a sucrose gradient. LC-MS analysis of the proteome showed that the nucleoid fraction was enriched in DNA-binding proteins compared to the cell lysate. Such an analysis will help to find new nucleoid-associated proteins and to study their dynamics, distribution, and their importance during infection and under stress conditions.