Онкология
Роль длинных некодирующих РНК CCAT1 и SNHG14 в активации ряда белок-кодирующих генов, связанных с развитием рака яичников
О.И.Бровкина1,2, И.В.Пронина1, А.М.Бурдённый1, Л.А.Урошлев1,3, Е.А.Филиппова1, М.В.Фридман3, Т.П.Казубская4, К.И.Жорданиа4, В.И.Логинов1, Н.Е.Кушлинский4, Э.А.Брага1 - 764-768
1НИИ общей патологии и патофизиологии, Москва, РФ; 2Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА России, Москва; 3Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, Москва; 4ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва
Поздняя диагностика рака яичников представляет одну из важнейших проблем в его лечении. Длинные некодирующие РНК (днРНК) мало изучены, но перспективны в качестве диагностических биомаркеров. Изучали интерактом днРНК для выявления биомаркеров с потенциальной значимостью для молекулярной диагностики рака яичников. С помощью скрининга базы данных TCGA выявили дифференциально экспрессируемые днРНК CCAT1 и SNHG14. На основании показателей комплементарности CCAT1 и SNHG14 последовательностям мРНК были выбраны 5 белок-кодирующих генов: MAPK1, с-MET, TGFB2, SNAIL1, WNT4, которые связаны с эпителиально-мезенхимальным переходом. Методом ПЦР в реальном времени в 54 образцах рака яичника подтверждена высокая экспрессия CCAT1 и SNHG14 (logFC>1.5, p<0.05). Установлена положительная корреляция между уровнями экспрессии двух днРНК и мРНК пяти генов эпителиально-мезенхимального перехода в шести парах. Активирующее влияние CCAT1 и SNHG14 на экспрессию этих генов может реализовываться при посредничестве miR-203 и miR-124.
Ключевые слова: рак яичников; длинные некодирующие РНК; микроРНК; эпителиально-мезенхимальный переход; биомаркеры
Адрес для корреспонденции: brov.olia@gmail.com Бровкина О.И.
DOI: 10.47056/0365-9615-2021-172-12-764-768
The role of long non-coding RNAs CCAT1 and SNHG14 in the activation of a number of protein-coding genes associated with the development of ovarian cancer
O. I. Brovkina1,2, I. V. Pronina1, A. M. Burdennyy1, L. A. Uroshlev1,3, E. A. Filippova1, M. V. Fridman3, T. P. Kazubskaya4, K. I. Zhordania4, V. I. Loginov1, N. E. Kushlinsky4, and E. A. Braga1
1Research Institute of General Pathology and Pathophysiology, Moscow, Russia; 2Federal Research Clinical Center of Specialized Types of Medical Care and Medical Technologies, Federal Medical-Biological Agency of Russia, Moscow, Russia; 3N. I. Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia; 4N. N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia
Late diagnosis of ovarian cancer (OC) is one of the most important problems in its treatment. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are a poorly studied, but promising type of diagnostic biomarkers that requires detailed analysis. The aim of the investigation was to study the lncRNA interactome to identify biomarkers with potential significance for molecular diagnostics of OC. By screening the TCGA database, we identified differentially expressed lncRNAs CCAT1 and SNHG14. Based on the indices of complementarity of CCAT1 and SNHG14 to the mRNA sequences, we selected 5 protein-coding genes MAPK1, c-MET, TGFB2, SNAIL1, WNT4, which are associated with the epithelial-mesenchymal transition. Real-time PCR on 54 OC samples confirmed the high expression levels of CCAT1 and SNHG14 (logFC>1.5, p<0.05). It was established a positive correlation between the expression levels of two lncRNA and mRNA of 5 genes in 6 pairs. The activating effect of CCAT1 and SNHG14 on the expression of 5 genes can be mediated by miR-203 and miR-124.
Key Words: ovarian cancer; long non-coding RNAs, microRNAs, epithelial-mesenchymal transition, biomarkers