Содержание и архив номеров
2021 г., Том 172, № 12 ДЕКАБРЬ
Биофизика и биохимия
Идентификация и оценка способности Cdk5 фосфорилировать деубиквитинирующий фермент BRCC3 in vitro
При болезни Паркинсона повышены как экспрессия деубиквитинирующего фермента BRCC3 (BRCA1-BRCA2-содержащая комплексная субъединица), так и уровень Cdk5 (циклинзависимая протеинкиназа 5), участвующие в нейровоспалительном ответе. Регуляторный механизм Cdk5 в посттрансляционной модификации BRCC3 остаётся неясным. В данном исследовании выясняли, способна ли Cdk5 фосфорилировать BRCC3. Сайты фосфорилирования BRCC3 киназой Cdk5 были предсказаны с помощью программы GPS 5.0. Плазмиду His-BRCC3 конструировали путём клонирования гена BRCC3 в вектор pGEX-6P-1, после чего продукцию рекомбинантного белка His-BRCC3 индуцировали изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозидом. Белок His-BRCC3 выделяли с помощью аффинной хроматографии на His-Tag агарозе. Его сайты фосфорилирования также определяли с помощью программы GPS 5.0. Фосфорилирование рекомбинантного белка His-BRCC3 киназой Cdk5 in vitro детектировали масс-спектрометрией и вестерн-блоттингом. Показано, что Cdk5 может фосфорилировать деубиквитинирующий фермент BRCC3 in vitro, что может оказаться полезным для дальнейшего изучения механизма нейродегенерации.
Ключевые слова: фосфорилирование; циклинзависимая киназа 5 (Cdk5); BRCA1-BRCA2-содержащая комплексная субъединица 3 (BRCC3); киназная реакция; масс-спектрометрический анализ фосфорилирования
Адрес для корреспонденции: xyshao@glmc.edu.cn Shao X.Y.
DOI: 10.47056/0365-9615-2021-172-12-698-706
Identification and verification of Cdk5 phosphorylated deubiquitinating enzyme BRCC3 in vitro
It is known that the expression of the deubiquitinating enzyme BRCA1-BRCA2-containing complex subunit 3 (BRCC3) is increased, as well as Cyclin-dependent protein kinase 5 (Cdk5) in Parkinson's Disease (PD), and both of them to be involved in neuroinflammatory response. But the regulatory mechanism of Cdk5 on the post-translational modification of BRCC3 remains unclear. This study aimed to investigate the phosphorylation of Cdk5 on the BRCC3. Cdk5 phosphorylation of BRCC3 was predicted by GPS 5.0 software. His-BRCC3 plasmid was constructed by cloning the BRCC3 gene into pGEX-6P-1 vector, and then His-BRCC3 fusion protein was induced by IPTG and purified by His-tag purification agarose. The BRCC3 fusion protein was reacted with Cdk5 in vitro, and the phosphorylation was detected by mass spectrometry and Western blot. The results showed that multiple phosphorylation sites were predicted by GPS 5.0, and the His-BRCC3 fusion protein was successfully induced and purified. In vitro kinase assay, Western blot and mass spectrometry identified that Cdk5 can phosphorylate BRCC3. It has been demonstrated that the protein kinase Cdk5 can phosphorylate the deubiquitinating enzyme BRCC3 in vitro, which provide evidences for further study on the mechanism of neurodegeneration.
Key Words: phosphorylation; cyclin-dependent kinase 5 (Cdk5); BRCA1-BRCA2-containing complex subunit 3 (BRCC3); kinase reaction; phosphorylation mass spectrometry