Фармакология и токсикология
Метасеквенирование V3-V4 вариабельных районов гена 16S рРНК условно-патогенной микробиоты и биоценоз толстой кишки у подростков с ожирением
Исследованы условно-патогенные микроорганизмы в биоценозе толстой кишки у подростков с ожирением и нормальной массой тела. Выборка подростков формировалась из числа больных, направленных в клинику Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека. Биологический материал исследовали стандартными бактериологическими методами, представителей семейства Enterobacteriaceae дополнительно характеризовали на основании метагеномного секвенирования V3-V4 вариабельных районов гена 16S рРНК. У подростков с ожирением наблюдается дисбаланс микробиоты толстой кишки, характеризующийся низким содержанием представителей бифидо- и лактофлоры, спектром ассоциаций E. coli, высокой частотой выявления условно-патогенных микроорганизмов и их ассоциаций. Наиболее часто в кишечной микробиоте подростков с ожирением регистрировали представителей семейства Enterobacteriaceae.
buxarowa.ekaterina@yandex.ru Григорова Е.В.
10.47056/0365-9615-2020-170-9-312-317
Metasequencing of V3-V4 variable regions of the 16s rRNA gene of opportunistic microbiota and colon biocenosis in obese adolescents
Today studying the formation of associative structure of microbiota in the gut of adolescents with obesity is a topical area of bacteriology. The article presents the results of the study of opportunistic microorganisms in the colon biocenosis in adolescents with obesity and with normal weight. The participants were the patients of the Clinic of Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems (Irkutsk). Biological material was studied using standard bacteriological methods; members of the Enterobacteriaceae family were additionally characterized based on metagenome sequencing of V3-V4 variable regions of the 16S rRNA gene. We showed that adolescents with obesity had disbalance in the colon microbiota, characterized by a low content of bifidо- and lactoflora, a spectrum of Escherichia coli associations, and a high prevalence of opportunistic microorganisms and their associations. Bacteria of the Enterobacteriaceae family were most often registered in the gut microbiota of adolescents with obesity.