Онкология
Полиморфизм rs2072580 T>A в перекрывающихся промоторных областях генов SART3 и ISCU, связанный с риском развития рака молочной железы
А.О.Дегтярева1, Е.Ю.Леберфарб1,2, Е.Г.Ефимова2, И.И.Брусенцов1, А.В.Усова2, Е.Л.Лушникова4, Т.И.Меркулова1,3 - 88-91
1ФГБНУ ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, РФ; 2ФГБОУ ВО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава России, Новосибирск; 3ФГАОУ ВО Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, РФ; 4Институт молекулярной патологии и патоморфологии ФГБНУ ФИЦ фундаментальной и трансляционной медицины, Новосибирск, РФ
Проанализирована связь потенциально регуляторных полиморфизмов (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs207258 и rs4796672) с РМЖ. Выявлена достоверная ассоциация заболевания с rs2072580 T>A (p=0.001), расположенного в перекрывающихся промоторных областях генов SART3 и ISCU. У женщин с генотипом АА и АТ риск заболевания повышен в 6.7 (p=0.001) и 12 (p=0.001) раз соответственно по сравнению с генотипом ТТ. В кодоминантной модели наследования (AT vs. AA+TT) для генотипа АТ риск заболевания повышен в 4.2 раза (р=0.001). В рецессивной модели наследования (ТТ vs. АТ+АА) для генотипа ТТ риск заболевания снижен в 10 раз (р=0.001). Выявлены транскрипционные факторы CREB1 и REST, сайты связывания которых может изменять замена T→A rs2072580.
Ключевые слова: регуляторные однонуклеотидные полиморфизмы; генотипирование; рак молочной железы; SART3; ISCU
Адрес для корреспонденции: degtyareva_rso@mail.ru Дегтярева А.О.
The rs2072580T>A polymorphism in the overlapping promoter regions of the SART3 and ISCU genes is associated with breast cancer risk
A. O. Degtyareva1, E. Yu. Leberfarb1,2, E. G. Efimova2, I. I. Brusentsov1, A. V. Usova2, E. L. Lushnikova4, T. I. Merkulova1,3
1Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics, Siberian Division of Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia; 2Novosibirsk State Medical University, Novosibirsk, Russia; 3Novosibirsk National Research State University, Novosibirsk, Russia; 4Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine, Novosibirsk, Russia
An association was found and explored between BC and potentially regulatory polymorphisms (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs207258 and rs4796672). A significant association was found between this disease and rs2072580T>A (p=0.001) located in the overlapping promoter regions of the SART3 and ISCU genes. Under a codominant model of inheritance (AT vs AA+TT), the risk of disease was increased 4.2-fold (р=0.001) for the АТ genotype. Under a recessive model of inheritance (ТТ vs AA+TT), the risk of disease was decreased 10-fold (р=0.001) for the TТ genotype. It has been demonstrated that the T>A substitution affects the binding properties of the transcription factors CREB1 and REST.
Key Words: regulatory single-nucleotide polymorphisms; genotyping; breast cancer; SART3; ISCU