Онкология
Системы маркеров на основе метилирования генов микроРНК в диагностике рака молочной железы на I-II стадиях
Э.А.Брага1,2, Е.А.Филиппова1, В.И.Логинов1,2, И.В.Пронина1, А.М.Бурденный1, Т.П.Казубская3, М.В.Фридман4, Д.С.Ходырев5, Н.Е.Кушлинский3 - 238-242
1НИИ общей патологии и патофизиологии, Москва, РФ; 2Медико-генетический научный центр, Москва, РФ; 3ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва; 4Институт общей генетики РАН им. Н.И.Вавилова РАН, Москва; 5ФНКЦ специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА России, Москва
Определены группы генов микроРНК, метилирование которых ассоциировано с начальными I и II стадиями рака молочной железы, и на основе этих данных выбраны новые маркеры и системы маркеров для диагностики заболевания. С применением метилспецифичной ПЦР на представительной выборке из 70 образцов опухоли идентифицированы 14 генов, метилирование которых ассоциировано с раком молочной железы. Анализ выборки из 46 образцов от пациенток на I и II клинических стадиях выявил 9 генов (MIR-124-1, MIR-124-3, MIR-125b-1, MIR-129-2, MIR-132, MIR-148a, MIR-193a, MIR-34b/c, MIR-9-3), метилирование которых ассоциировано с начальными стадиями заболевания. С помощью ROC-анализа составлены две шестимаркерные системы, которые позволяют выявлять рак молочной железы на I-II стадии с высокой чувствительностью (89 и 91%) и специфичностью (88%) при AUC=0.92-0.93. Эти наборы валидированы на полной выборке из 70 образцов, включающей все стадии заболевания (чувствительность 93 и 94%, специфичность 88%, AUC=0.95). Разработаны высокочувствительные системы маркеров на основе метилирования генов микроРНК для диагностики рака молочной железы на I-II стадии заболевания.
Ключевые слова: гены микроРНК, гиперметилирование, рак молочной железы, ROC-анализ, диагностические системы маркеров
Адрес для корреспонденции: eleonora10_45@mail.ru Брага Э.А.
Marker systems based on the methylation of mirna genes for the diagnostics of breast cancer in the early stages
E. A. Braga1,2, E. A. Filippova1, V. I. Loginov1,2, I. V. Pronina1, A. M. Burdennyi1, T. P. Kazubskaya3, M. V. Fridman4, D. S. Khodyrev5, N. E. Kushlinskii3
1Research Institute of General Pathology and Pathophysiology, Moscow, Russia; 2Research Center of Medical Genetics, Moscow, Russia; 3N.N.Blokhin National Medical Research Center of Oncology, the Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia; 4N.I.Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia; 5Federal Research Clinical Center of Specialized Types of Medical Care and Medical Technologies Federal Medical-Biological Agency, Moscow, Russia
Groups of miRNA genes whose methylation is associated with breast cancer, including stage I and stage II, have been identified, and on the basis of these data, new markers and marker systems have been selected for the diagnostics of breast cancer at I-II stages. With the use of methylation specific PCR and a representative set of 70 samples of breast cancer, 14 genes have been identified whose methylation is associated with breast cancer. An analysis of a set of 46 samples from patients at clinical stages I and II revealed 9 genes (MIR-124-1, MIR-124-3, MIR-125b-1, MIR-129-2, MIR-132, MIR-148a, MIR-193a, MIR-34b/c, MIR-9-3), the methylation of which is associated with the early stages. Using the ROC analysis, two 6-marker systems were compiled that allow early detection of breast cancer with high sensitivity (89%, 91%) and specificity (88%) with AUC = 0.92-0.93. These systems were validated on the complete set of 70 samples, including all stages of breast cancer (sensitivity 93% and 94%, specificity 88%, AUC = 0.95). Thus, highly sensitive marker systems based on the methylation of miRNA genes for the diagnostics of breast cancer in the I-II stages were developed for the first time.
Key Words: Key Words: microRNA genes; hypermethylation; breast cancer; ROC analysis; diagnostic marker systems