Содержание и архив номеров
2019 г., Том 168, № 11 НОЯБРЬ
Биофизика и биохимия
Пептид КЕ в протеоме человека
Пептид KE обладает иммунопротективным, геропротективным, онкостатическим действием, стимулирует функциональную активность фибробластов. Мотив KE встречается в аминокислотных последовательностях некоторых цитокинов и пептидных гормонов, по своим функциям сходных с пептидом KE. Однако связь между наличием мотива KE и функциями белков в масштабах известного протеома человека не изучена. Определяли частоту встречаемости биорегуляторного пептида КЕ в составляющих протеом человека белках разных функциональных групп. Использовали общедоступный протеом человека (портал UniProt) объёмом 20 417 белков. Цитоплазматические и ядерные белки содержали наибольшее количество KE-мотивов, тогда как цитоплазматические и все прочие белки имели минимум содержания KE. В ходе ограниченного протеолиза молекулы пептида КЕ, высвобождаемые из ядерных белков, могут связываться с ДНК и регулировать экспрессию генов.
Ключевые слова: пептид KE; протеом человека; ядерные белки; экспрессия генов
Адрес для корреспонденции: miayy@yandex.ru Линькова Н.С.
KE peptide in human proteome
KE peptide has immunoprotective, geroprotective, oncostatic properties, stimulates the functional activity of fibroblasts. It is known that the KE motif is found in the amino acid sequences of certain cytokines and peptide hormones in their functions similar to the KE peptide. However, the relationship between the presence of the KE motif and protein functions on the scale of a known human proteome has not been studied. The aim of research is to analyze the incidence logic of KE motif in human proteins of different functional groups. We used the public human proteom with 20417 proteins volume from UniProt portal. We found that cytoplasmic and nuclear proteins contain the greatest number of KE motifs, and cytoplasmic and all other proteins have minimum KE motifs. During limited proteolysis, KE peptide molecules released from nuclear proteins can bind to DNA and regulate gene expression.
Key Words: KE peptide; human proteome; nuclear protein; gene expression