Онкология
Сравнительный анализ протеома плазмы крови больных почечно-клеточным раком
А.Л.Кайшева, А.Т.Копылов, Н.Е.Кушлинский*, Е.С.Герштейн*, А.А.Алферов*, А.А.Морозов**, И.А.Казанцева**, Т.О.Плешакова, А.И.Арчаков, Ю.Д.Иванов - 99-104
ФГБНУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, РФ; *ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва; **ГБУЗ Московский областной научно-исследовательский клинический институт им. М.Ф.Владимирского, Москва, РФ
Проведен сравнительный масс-спектрометрический анализ состава белков в 36 образцах плазмы крови больных почечно-клеточным раком и в 20 образцах здоровых доноров. В результате анализа белкового состава обедненных от мажорных фракций белков образцов плазмы крови выявлено, что число идентификаций в образцах крови больных на 20-50% больше. По белковому составу образцы контрольной и опытной серии схожи, совпадение идентификаций составляет 70-80% относительно контрольной серии. Наблюдается высокое сходство биологических процессов, в которых участвуют выявленные в обеих сериях белки. Обнаружено, что большая часть белков обеих серий локализуется внеклеточно и является экзосомальной (образцы больных раком почки) или везикулярной (образцы здоровых добровольцев).
Ключевые слова: почечно-клеточный рак, плазма крови, жидкостная хромато-масс-спектрометрия, панорамный анализ
Адрес для корреспонденции: kaysheva1@gmail.com Кайшева А.Л.
Comparative analysis of blood plasma proteome in patients with renal cell carcinoma
A. L. Kaysheva1, A. T. Kopylov1, N. E. Kushlinskii2, E. S. Gershtein2, A. A. Alferov2, A. A. Morozov3, I. A. Kazantseva3, T. O. Pleshakova1, A. I. Archakov1, and Yu. D. Ivanov1
1V. N. Orekhovich Research Institute of Biomedical Chemistry; 2N. N. Blokhin National Medical Center of Oncology, the Ministry of Health of Russia; 3M. F. Vladimirsky Moscow Regional Research and Clinical Institute, Moscow, Russia.
Comparative mass spectrometric analysis of protein composition was carried out in 36 blood plasma specimens from patients with renal cell carcinoma and 20 specimens from donors. Analysis of protein composition of plasma specimens devoid of the major protein fractions showed a 20-50% higher level of protein identifications in patient’ specimens. Specimens of the control and experimental series were similar by protein composition, 70-80% identifications in experimental and control series coinciding. High similarity of biological processes with participation of the proteins identified in both series was observed. The greater part of proteins in both series were located extracellularly and were exosomal (specimens from renal cancer patients) or vesicular (specimens from healthy volunteers).
Key Words: renal cell carcinoma; blood plasma; liquid chromato-mass-spectrometry; panoramic analysis