Онкология
Гиперметилированные гены микроРНК в карциноме яичников: системы маркеров прогноза метастазирования
Е.А.Филиппова1, В.И.Логинов1,2, А.М.Бурденный1, Э.А.Брага1,2, И.В.Пронина1, Т.П.Казубская3, Д.Н.Кушлинский3, Д.О.Уткин3, М.В.Фридман4, Д.С.Ходырев5, Н.Е.Кушлинский3 - 86-90
1Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии, Москва, РФ; 2Медико-генетический научный центр, Москва, РФ; 3ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина Минздрава России, Москва; 4Институт общей генетики РАН, Москва, РФ; 5Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА России, Москва
Определена группа генов микроРНК, метилирование которых ассоциировано с метастазированием рака яичников, и на основе этих данных выбраны новые прогностические маркеры и системы маркеров в отношении процесса диссеминации опухоли. С применением метилспецифичной ПЦР на представительной выборке из 54 образцов рака яичников идентифицированы 10 генов микроРНК (MIR-124а-2, MIR-127, MIR-125b-1, MIR-129-2, MIR-137, MIR-193a, MIR-203a, MIR-34b/c, MIR-130b, MIR-1258), метилирование которых ассоциировано с метастазированием. Наиболее значимая ассоциация определена для 4 генов: MIR-137, MIR-193a, MIR-34b/c, MIR-130b (p<0.01). С помощью ROC-анализа определены три наиболее оптимальные системы маркеров, включающие от 4 до 5 генов микроРНК, которые характеризуются высокой чувствительностью (82-94%) и специфичностью (76-86%) при AUC=0.89-0.92. Метилирования любых трех генов из данных систем достаточно для прогноза метастазирования у пациента с указанной точностью. Определение группы гиперметилированных генов микроРНК с прогностическим значением в отношении метастазирования рака яичников имеет большое значение для персонализированного лечения больных.
Ключевые слова: гены микроРНК, гиперметилирование, рак яичников, метастазирование, система маркеров
Адрес для корреспонденции: eleonora10_45@mail.ru Брага Э.А.
Hypermethylated genes of microRNA in ovarian carcinoma: metastasis prediction marker systems
E. A. Filippova1, V. I. Loginov1,2, A. M. Burdennyi1, E. A. Braga1,2, I. V. Pronina1, T. P. Kazubskaya3, D. N. Kushlinskii3, D. O. Utkin3, M. V. Fridman4, D. S. Khodyrev5, and N. E. Kushlinskii3
1Research Institute of General Pathology and Pathophysiology; 2Research Center for Medical Genetics; 3N. N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of the Russian Fed- eration; 4N. I. Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences; 5Federal Scientifi and Clinical Center of Specialized Medical Care and Medical Technologies, Federal Medical-Biological Agency of the Russia, Moscow, Russia.
We identified a group of miRNA genes whose methylation is associated with ovarian cancer metastasis. Based on these data, new markers and the systems of markers predicting tumor dissemination were selected. Using methylation-specific PCR and a representative set of 54 ovarian cancer samples, we identifi d 10 microRNA genes (MIR-124a-2, MIR-127, MIR- 125b-1, MIR-129-2, MIR-137, MIR-193a, MIR-203a, MIR-34b/c, MIR-130b, and MIR-1258) whose methylation is associated with tumor metastasis. The greatest association was estab- lished for 4 genes: MIR-137, MIR-193a, MIR-34b/c, and MIR-130b (p<0.01). ROC analysis revealed 3 most optimal marker systems including 4-5 miRNA genes and characterized by high sensitivity (82-94%) and specificity (76-86%) at AUC=0.89-0.92. Methylation of any three genes from these systems is sufficient to predict metastasis with the specified accuracy. Detection of the group of hypermethylated miRNA genes with predictive value for ovarian cancer metastasis is of great importance for personalized treatment of the patients.
Key Words: miRNA genes; hypermethylation; ovarian cancer; metastasis; marker system