Экспериментальная биология
Детекция низкопредставленных микроРНК с помощью гибридизационных микрочипов
М.Ю.Шкурников, Е.Н.Князев*, К.А.Фомичева,  М.С.Касаткин**, В.В.Арьков***, Ю.А.Макарова - 757-761
МНИОИ им. П.А.Герцена — филиал ФГБУ НМИЦ радиологии Минздрава России, Москва; *ООО “БиоКлиникум”, Москва, РФ; **Кафедра спортивной медицины и медицинской реабилитации ФГАОУ ВО Первого МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России, Москва; ***Филиал №; 1ГАУЗ Московский научно-практический центр медицинской реабилитации, восстановительной и спортивной медицины ДЗ г. Москвы, Москва, РФ
Исследовали влияние низких концентраций микроРНК на способность гибридизационных чипов “GeneChip miRNA 4.0” оценивать их представленность в образце. Показано, что оценка экспрессии 61 микроРНК статистически значимо связана с кратностью разведения плазмы крови. Только 12 микроРНК обладали весьма высоким коэффициентом корреляции Пирсона (более 0.95), и все они снижались в ответ на разведение. Продемонстрирована высокая представленность микроРНК hsa-miR-4532 в плазме крови. Данная микроРНК не выявлялась ранее при секвенировании аналогичных образцов. Сделан вывод о том, что при экспрессии микроРНК ниже 1.12±0.33 ед. в log2-шкале при разведениях уменьшение сигнала на чипах “GeneChip miRNA 4.0” уже не наблюдается.
Ключевые слова: гибридизационные чипы, микроРНК, чувствительность
Адрес для корреспонденции: mshkurnikov@imscs.msu.ru Шкурников М.Ю.