Методами количественной ПЦР исследовали биопленку зубодесневой борозды 22 человек с сахарным диабетом 2-го типа в сочетании с пародонтитом, а также 30 пациентов с пародонтитом, не отягощенным сахарным диабетом (группа сравнения), и 22 здоровых людей без признаков поражения десен (контрольная группа). Количественную оценку содержания P. gingivalis, T. forsythia, A. actinomycetemcomitans, T. denticola, P. intermedia, F. nucleatum/periodonticum, P. endodontalis в зубодесневом налете проводили с использованием набора “Дентоскрин”. Наличие бактерий каких-либо других групп (семейств, родов) анализировали методом метагеномного секвенирования гена 16S рРНК для выявления особенностей этиологического фактора пародонтита при сахарном диабете 2-го типа. Установлено, что частота встречаемости представителей семейств Porphiromonadaceae и Fusobacteriaceae при сочетанной патологии была значительно выше, а при пародонтите в целом отмечено достоверное снижение в биопленке бактерий семейства Sphingobacteriaceae. Метагеномный анализ подтвердил патогенетическую роль микробиоты при сочетанной патологии и гипотезу о возможном влиянии пародонтита на течение и развитие сахарного диабета 2-го типа.