Онкология
Поиск in silico микроРНК, регулирующих рецепторный статус рака молочной железы, и экспериментальное подтверждение их экспрессии в опухолях
В.С.Черный1,2, П.В.Тарасова2, В.В.Козлов3, О.В.Сайк4,5, Н.Е.Кушлинский6, Л.Ф.Гуляева1,2 - 613-618
1ФГБНУ НИИ молекулярной биологии и биофизики, Новосибирск, РФ; 2Новосибирский государственный исследовательский университет, Новосибирск, РФ; 3ГБУЗ НСО Новосибирский областной онкологический диспансер, Новосибирск, РФ; 4ООО “АкадемДжин”, Новосибирск, РФ; 5Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, РФ; 6ФГБУ РОНЦ им. Н.Н.Блохина Минздрава РФ, Москва
С помощью биоинформатического анализа выбран ряд микроРНК, экспрессия которых меняется в зависимости от рецепторного статуса РМЖ. В 76 образцах РМЖ с разным рецепторным фенотипом проанализирована экспрессия 9 микроРНК: 16, 17, 21, 27, 125, 146, 155, 200а, 221. Экспрессия микроРНК 155, 27 и 200а в разных типах РМЖ не различалась. Подтверждены данные о прямой корреляции экспрессии микроРНК-21 и микроРНК-221 с негативным рецепторным статусом опухоли. Показано снижение экспрессии онкосупрессорной микроРНК-125b в образцах РМЖ, экспрессирующих HER2 и ER, а также в тройном негативном РМЖ, что указывает на ее универсальность в качестве маркера РМЖ. Показано повышение экспрессии микроРНК-16 в образцах РМЖ, экспрессирующих HER2 и ER. Выявлено снижение экспрессии микроРНК-17 в тройном негативном РМЖ и увеличение — в ER+, PR+ и HER+ типах РМЖ. Установлено снижение экспрессии микроРНК-146b в ER+ и HER+ типах РМЖ. МикроРНК 16, 17, 21, 125b, 146b, 221 могут быть перспективными маркерами для дифференциальной диагностики различных фенотипов РМЖ.
Ключевые слова: микроРНК, in silico, рак молочной железы, рецепторы эстрогена и прогестерона, HER2
Адрес для корреспонденции: gulyaeva@niimbb.ru Гуляева Л.Ф.