Методики
Сравнительные особенности дискриминации изолятов S. enterica с использованием метода фаготипирования и теста Диенеза
Предложен оригинальный методический подход дискриминации изолятов Salmonella enterica на основе теста Диенеза. Тест Диенеза используется для идентификации штаммов P. vulgaris и P. mirabilis. Суть теста заключается в подавлении роста культурами подвижных штаммов бактерий, при этом между растущими навстречу друг другу штаммами образуется демаркационная линия (линия Диенезa). Выявлены сходства и различия метода фаготипирования сальмонелл и дискриминации на основе теста Диенеза. Исследуемая выборка сальмонелл была разделена на 12 фаготипов. Кластерный анализ показал, что бульшая часть штаммов сальмонелл по обоим методам не кластеризуется. Наиболее крупные кластеры содержат одни и те же штаммы при их дискриминации разными методами. Кластеризация штаммов сальмонелл на основании разных методов показывает умеренную конгруэнтность. Индекс Ранда, позволяющий сравнивать результаты кластеризации выборки на основе разных методов, составил 0.88. Высокая гетерогенность штаммов сальмонелл, вероятно, обусловлена гетерогенностью факторов антагонизма внутри вида S. enterica. Внутривидовой антагонизм необходим для ограничения горизонтального переноса генов у близкородственных штаммов и повышения генетической гетерогенности популяции сальмонелл в организме.
lisocim@mail.ru Афонюшкин В.Н.