Короткие пептиды представляют собой систему сигнальных молекул, регулирующих функции организма на молекулярно-генетическом, субклеточном, клеточном и тканевом уровне. Один короткий пептид может регулировать экспрессию нескольких десятков генов, однако молекулярный механизм этого процесса остается открытым. Мы полагаем, что короткие пептиды способны проникать через цитоплазматическую и ядерную мембрану клетки и связываться с ДНК. Методом докинга построены пространст­венные модели ДНК-пептидных комплексов для 19 коротких пептидов. Установлено, что некоторые пептиды имеют одинаковые сайты связывания. Пептиды KE и EDP связываются с ДНК по сайту agat, пептиды KEDW и AED — по сайту acct, а пептиды AEDL и EDL — по сайту ctcc.