Содержание и архив номеров
2013 г., Том 156, № 11 НОЯБРЬ
Методики
О построении медицинских тест–систем с использованием жадного алгоритма и метода опорных векторов
В работе приводится формализованная постановка задачи об отборе параметров и построении классификатора для геномной медицинской тест–системы математическими методами машинного обучения без использования специальных биологических и медицинских знаний. Предлагается метод решения данной задачи и обсуждаются результаты апробации этого метода на мирочиповом наборе данных, содержащем информацию о полногеномном транскриптоме образцов эстрогенположительных опухолей молочной железы. Апробация показала, что качество классификации, обеспечиваемое построенной тест–системой и осуществляемой на основе оценок экспрессии 12 генов, не уступает качеству классификации, осуществляемой такими тест–системами, как “OncotypeDX” и “MammaPrint”.
Ключевые слова: медицинская тест–система, жадный алгоритм, метод опорных векторов, машинное обучение, полногеномный транскриптом
Адрес для корреспонденции: vgalat@imscs.msu.ru Галатенко В.В.