Онкология
Сопоставление результатов ПЦР–анализа экспрессии генов в образцах опухолевой ткани молочной железы, стабилизированных в формалине и RNAlater
Н.А.Хаустова1, Д.С.Макеева1,2, О.В.Кондрашина1,2, Н.Н.Федотов2, И.Н.Нечаев3, Н.А.Савелов4, В.Н.Гриневич4, Д.В.Мальцева1, В.В.Галатенко1,2, М.Ю.Шкурников3 - 473-478
1НТЦ “БиоКлиникум”; 2МГУ им. М.В.Ломоносова; 3ФГБУ НИИ общей патологии и патофизиологии РАМН, Москва; 4Московская городская онкологическая больница № 62 Департамента здравоохранения г. Москвы, пос. Истра, Московская область
На образцах опухолевой ткани молочной железы проведен сравнительный анализ уровней экспрессии генов, полученных методом ПЦР в реальном времени для парных образцов: фиксированных в стабилизационном реагенте RNAlater Qiagen (FF–образцы) и формалине (FFPE–образцы). Показано, что между оценками логарифмов экспрессий генов в FF– и FFPE–образцах имеется выраженная линейная зависимость (коэффициент корреляции 0.76±0.07). Данный факт свидетельствует о возможности эффективного использования в современных исследованиях коллекций парафиновых блоков, содержащих фиксированные в формалине образцы тканей пациентов с многолетней историей болезни.
Ключевые слова: ПЦР в реальном времени, экспрессия гена, фиксация в формалине, RNAlater, рак молочной железы
Адрес для корреспонденции: khaunadia@gmail.com Хаустова Н.А.