Оценивали возможность применения высокочувствительного анализа кривых плавления (HRM) для предварительного скрининга генов-кандидатов метилирования при колоректальном раке (КРР). Исследование выполнено на 40 парных FFPE-образцах опухолевой и прилежащей морфологичес­ки неизменённой ткани пациентов с КРР. После бисульфитной конверсии ДНК проводили ПЦР с последующим HRM-анализом CpG-регионов генов ALX4, BCAT1, BMP3, METAP1D, SDC2, SEPT9 и SHOX2. Статистически значимые различия в уровне метилирования опухолевой и прилежащей морфологически неизменённой ткани выявлены для генов ALX4, BCAT1 и BMP3 (p < 0,05). Для контрольного маркера SDC2 также обнаружены статистически значимые различия, подтверждающие воспроизводимость HRM-подхода. Наиболее высокую диагностическую точность продемонстрировал ген ALX4 (AUC = 0,966; чувствительность 90 %; специфичность 95 %). Для BCAT1 и BMP3 значения AUC составили 0,886 и 0,871 соответственно. Для генов METAP1D, SEPT9 и SHOX2 достоверных различий выявлено не было. Полученные результаты свидетельствуют о возможности использования HRM-анализа в качестве быстрого метода предварительного отбора перспективных CpG-регионов и генов-кандидатов метилирования при КРР.

We evaluated the applicability of high-resolution melting (HRM) analysis for the preliminary screening of candidate methylation genes in colorectal cancer (CRC). The study was performed on 40 paired formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples of tumor and adjacent morphologically normal tissue from patients with CRC. Following bisulfite conversion of DNA, polymerase chain reaction (PCR) and subsequent HRM analysis were carried out for the CpG regions of the ALX4, BCAT1, BMP3, METAP1D, SDC2, SEPT9, and SHOX2 genes. Significant differences in methylation levels between tumor tissue and adjacent histologically normal tissue were identified for ALX4, BCAT1, and BMP3 (p < 0.05). For the SDC2 control marker, statistically significant differences were also found, confirming the reproducibility of the HRM approach. ALX4 demonstrated the highest diagnostic performance (AUC = 0.966, sensitivity 90 %, specificity 95 %). The AUC values for BCAT1 and BMP3 were 0.886 and 0.871, respectively. No statistically significant differences were observed for METAP1D, SEPT9, or SHOX2. These findings indicate that HRM analysis may serve as a rapid method for the preliminary identification of promising CpG regions and candidate methylation genes in CRC.